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分子育種——助民族種業(yè)“跑”得更快

   日期:2015-05-11     來源:聚農網(wǎng)    作者:jn720.com    瀏覽:197    評論:0    
  “一票否決”,品種審定的“鐵門檻”讓水稻種企對如何提高稻瘟病抗性格外關注。 
 
  然而,篩選抗稻瘟病基因,受到環(huán)境條件的限制。雖然水稻從抽穗到成熟,都易發(fā)稻瘟病,但要發(fā)病,易感品種和低溫連陰天缺一不可,因此在自然種植條件下,稻瘟病并不會年年重發(fā),要驗證材料的抗病性,往往需要人工接種病菌,工作量很大,成本也很高。 
 
  同時,引起稻瘟病的生理小種又是不斷變化的。就像流感病毒一樣,前兩年有效的流感疫苗今年就可能不管用了,所以選育抗稻瘟病的品種就如同和病菌變種進行一場你追我趕的“持久性賽跑”。 
 
  有沒有一種辦法,能夠加快篩選速度,獲得市場所需的育種材料來定向改良品種呢?答案就是分子育種。為什么是分子育種?分子育種是怎樣加快篩選速度的?為了尋找問題的答案,記者來到了我國兩大農作物分子育種平臺之一的華智水稻生物技術有限公司。 
 
  什么是分子育種? 
 
  ——分子育種和常規(guī)育種就像西醫(yī)和中醫(yī),必須中西醫(yī)結合,才能取得高效益的理想效果 
 
  要知道分子育種為什么能幫助育種家跑得更快,首先需要了解什么是分子育種。 
 
  “如果說常規(guī)育種是看中醫(yī)、看表型,分子育種就類似西醫(yī)拍的一張張X光片,看品種內部的各種基因型。”華智總經(jīng)理張健解釋說,有經(jīng)驗的老中醫(yī)拍拍背,可以憑經(jīng)驗猜出來肺部有沒有鈣點,但沒有百分之百的把握;分子育種技術類似能給醫(yī)生提供一個X光片,有沒有鈣點一目了然。當然,分子育種也有誤差,但這種誤差跟沒有X光片時的判斷相比,精準度高很多。 
 
  在張健看來,常規(guī)育種憑經(jīng)驗選育的過程就像一個“黑匣子”,肉眼只能區(qū)分抗病和感病,并不知道種子所具有的基因型是什么,更看不出抗病材料是雜合抗病還是純合抗病,而純合抗病材料才是育種家能夠利用的育種材料。分子育種能夠幫助育種家打開并解讀這只“黑匣子”,區(qū)分哪些是純合抗病材料,哪些是雜合抗病材料,利用純合抗病材料來加快育種進程。 
 
  打開“黑匣子”,對育種效率與效益的提升主要體現(xiàn)在兩個方面。一是縮短育種時間。用常規(guī)育種手段定向改良一個農藝性狀,需要回交6代才能得到理想的植株,一般需要5年~6年時間,而利用分子育種技術,通過早期的基因型選擇,只需要3年左右,育種時間可以縮短一半。二是降低田間測試材料數(shù)量。假設有2個抗病材料,傳統(tǒng)育種方法需要足夠大的回交群體才可能獲得想要的材料,但分子育種技術可以通過基因型分型篩選,先把含有抗病基因的材料篩選出來,這樣就可以節(jié)省很多耕地。 
 
  “分子育種只需要一片水稻葉子,就能在基因型水平上診斷這種材料抗病不抗病,是純合抗病還是雜合抗病,但選擇的材料好不好,最終還是要到大田里看效果。”張健說,分子育種和常規(guī)育種一樣,都是一種技術手段,分子育種要用得好,取得好效果,必須和其他技術手段結合起來。分子標記、生物信息、種質創(chuàng)新、大田測試就像一張桌子的四條腿,多功能研發(fā)部門綜合在一起才能形成高效的分子育種大平臺。 
 
  隨著種植方式的轉變和消費水平的提高,水稻育種的目標正在從單純的高產(chǎn)向高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)、多抗廣適、品質優(yōu)良、資源節(jié)約、環(huán)境友好、高效益等多重目標轉變。“沒有最好的品種,只有最適合的品種。”張健說,育種就是要根據(jù)不同區(qū)域的水土光溫條件,篩選出最優(yōu)的基因組合,而分子育種能夠快速鎖定并聚合高產(chǎn)、多抗、口感好等優(yōu)良性狀的相關基因,既能幫育種家快速培養(yǎng)出“三好生”,也可以幫育種家培養(yǎng)更多適合不同區(qū)域的“特長生”。 
 
  “X光片”如何“拍”出? 
 
  ——水稻的12對染色體就像12條高速公路,分子標記就像設在高速公路上的路標 
 
  華智承擔著建設農業(yè)部國家水稻分子育種大平臺的重任。進入華智第一個實驗室,在10多平方米的空間里,3臺巨大的黑色儀器呈“L”型擺開。“這是剛到位的道格拉斯陣列式分析卷帶(DouglasArrayTape)高通量SNP檢測平臺,目前是全球通量最高的基因分型平臺。”張健介紹說。 
 
  什么是通量?高通量意味著什么?“通量表示物質分子移動量的大小,通量越高則單位時間內完成的測試量越大。”張健解釋說,“只有通量上去了,研發(fā)成本才能降下來。” 
 
  據(jù)了解,人工操作,一天一個人最多能做幾百個SNP測試,而用這套設備,每天可以做23萬個SNP測試,相當于2400臺普通96孔的PCR儀同時開動。目前,設備已經(jīng)調試完畢,為了盡快投入商業(yè)化使用,華智正加緊開發(fā)水稻全基因組分子標記,今年的目標是做出2000個分子標記來。 
 
  什么是分子標記?分子標記有什么用?“分子標記是可遺傳、可檢測的DNA序列,相當于高速公路的路標。”張健解釋道,如果把一條染色體比作一條高速公路,基因測序相當于建高速公路,分子標記就像是在高速公路上設路標。分子標記越多,路標越精確,定位的精度也越高。有了大量的路標,就可以像GPS一樣精準定位,快速鎖定要找的基因。 
 
  水稻有12條染色體,每一條染色體上有大量DNA,但并不是每個DNA都能成為標記,分子標記要發(fā)揮作用,關鍵在于找到那些通過實驗室與大田驗證,與高產(chǎn)、抗病或是抗倒伏直接相關的DNA序列,并把這些DNA分子標記開發(fā)出來。 
 
  標記的方式很重要。“分子標記需要檢測手段簡單、快速、容易自動化,同時成本低、重復性好。”張健告訴記者,單個核苷酸的改變,就能體現(xiàn)出DNA序列的變化,因此單核苷酸多態(tài)性(SNP)檢測是目前最準確、最快速也最適于自動化操作的分子標記手段。 
 
  分子標記一旦驗證完畢,對相應基因的搜索就變得如探囊中之物一般便利。“利用道格拉斯高通量SNP檢測設備,2天~3天就能得出精確的檢測結果。”張健給記者展示了一組品種純度和真實性鑒定的結果,由于單個SNP被開發(fā)成能用熒光檢測的PCR產(chǎn)物,檢測結果在電腦屏幕上呈現(xiàn)出不同的顏色——基因型相同的顏色相同,基因型不同的顏色不同。是不是一個品種,品種純度高不高,就像“X光片”一樣一目了然。 
 
  分子育種平臺改變什么? 
 
  ——種業(yè)研發(fā)缺乏轉化的環(huán)節(jié),分子育種平臺就是要將“沉睡”的資源喚醒盤活 
 
  目前,SNP分子標記等分子育種技術已成為跨國種業(yè)巨頭加快培育新品種的一種利器。孟山都、杜邦先鋒均有多套道格拉斯高通量SNP檢測設備。如果國內種業(yè)僅用常規(guī)育種手段來應對挑戰(zhàn),則無異于坐著牛車和汽車賽跑。 
 
  然而,一套道格拉斯高通量SNP檢測平臺,即使不算耗材和人工成本,也需要上千萬元,對于每年研發(fā)投入至多幾千萬元的國內種企來說,單槍匹馬做分子育種既不實際也不實惠。為了解決單個企業(yè)做分子育種既“吃不起”也“吃不飽”的兩難困境,實現(xiàn)“同乘一輛車,各買一張票”,在農業(yè)部推動下,華智和中玉金標記兩大分子育種平臺應運而生。 
 
  “和普通的種業(yè)企業(yè)不同,我們不會把研發(fā)的種子直接賣給農民。”張健說,“兩大分子育種平臺定位于專業(yè)化高科技種業(yè)服務公司,主要任務就是為商業(yè)化育種單位提供分子育種服務。” 
 
  他介紹說,科研院所的研究人員克隆一個基因就可以發(fā)表論文,但要將此基因應用到育種生產(chǎn)上,還缺乏一個技術開發(fā)與成果轉化的環(huán)節(jié),分子育種平臺就是要為基礎理論成果向產(chǎn)業(yè)化轉化鋪路搭橋,因此不僅要在實驗室和大田條件下驗證基因的優(yōu)劣,而且要將優(yōu)良基因導入到商業(yè)化育種材料中,創(chuàng)造新的種質資源,幫助“沉睡”的基因或資源變成商業(yè)化育種中真正有價值的材料。 
 
  在國外開發(fā)1個轉基因農產(chǎn)品需要1.36億美元,其中早期研發(fā)的投入約占23%,中期驗證占51%,后期推廣、法規(guī)等方面投入占26%左右,中間驗證及產(chǎn)業(yè)化開發(fā)的費用要比早期研發(fā)高很多。而在國內,分子育種技術的研究還停留在早期概念階段,由于缺少成果驗證與產(chǎn)業(yè)化轉化環(huán)節(jié),不少基因材料只能停留在實驗室的抽屜里,這也導致種質創(chuàng)新停滯不前,進而制約了突破性大品種的選育。 
 
  解決科研成果轉化難,必須理順分工。“科研院所是上游,提供基因材料;分子育種平臺是中游,專注技術的集成和開發(fā);種業(yè)企業(yè)是下游,開展商業(yè)化育種和推廣。”張健說,科研院所的研究人員發(fā)現(xiàn)了一個抗病基因,但只有一個抗病基因的材料不能滿足實際生產(chǎn)需要,這就需要對不同抗原、不同抗性位點的材料進行驗證、集成和資源創(chuàng)新,然后將多抗的材料提供給下游公司。 
 
  張健認為,專業(yè)化種業(yè)技術服務公司的壯大,將從根本上改變種業(yè)知識產(chǎn)權交易的游戲規(guī)則——利用DNA指紋圖譜給每個品種建立“身份證”,利用商業(yè)化合同明確規(guī)范產(chǎn)業(yè)鏈利益的分成機制,能有效遏制“偷材料”等市場亂象發(fā)生。“市場的整體運作規(guī)范了,就能夠促進種業(yè)向更好的方向發(fā)展,農民就能用上更好的品種。”他說。
 
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