盡管甘肅省率先爭取省級財政支持補(bǔ)貼配方肥，廣泛開展宣傳培訓(xùn)，鼓勵引導(dǎo)企業(yè)生產(chǎn)配方肥，積極探索了許多行之有效的配方肥供應(yīng)模式。但是企業(yè)參與項目的積極性仍需進(jìn)一步調(diào)動，仍有許多難題亟待突破。
政策難題
據(jù)了解，當(dāng)前肥料登記中把配方肥納入摻混肥或復(fù)混肥管理，肥料企業(yè)需要生產(chǎn)許可證和肥料登記證，同時肥料登記實(shí)行“一品一證”，這個規(guī)定給配方肥的推廣造成一定困難。
省農(nóng)業(yè)節(jié)水與土壤肥料管理總站分析指出，一是大中型肥料企業(yè)不愿意生產(chǎn)配方肥。主要原因是配方肥區(qū)域性、針對性強(qiáng)，大中型企業(yè)肥料規(guī)模化生產(chǎn)、批量化供應(yīng)與配方肥小批量需求之間的矛盾難以突破。同時大中型企業(yè)配方肥生產(chǎn)量大、銷售區(qū)域廣、肥料種類多，實(shí)行“一品一證”后需要辦理的登記證較多，制板、包裝等制做時間長、費(fèi)用高，影響企業(yè)參與積極性。二是小型企業(yè)不能生產(chǎn)配方肥。小型肥料企業(yè)可以滿足配方到戶、到地、到村的需求，滿足農(nóng)民個性化需求，但多數(shù)小型肥料企業(yè)由于軟硬件受限不能辦理生產(chǎn)許可證，小型企業(yè)的存在與法律法規(guī)沖突，面臨著生存困境。三是經(jīng)銷企業(yè)不愿經(jīng)銷配方肥。目前市場上出現(xiàn)了氮磷鉀比例眾多的復(fù)混肥，很多氮磷鉀的比例與農(nóng)業(yè)部門公布的配方相近，而且不受作物、地點(diǎn)、季節(jié)的影響，便于產(chǎn)品生產(chǎn)、銷售和庫存，而配方肥銷售區(qū)域、適用作物限制性強(qiáng)，經(jīng)銷靈活性差，經(jīng)銷商不愿意經(jīng)銷配方肥。
有關(guān)部門建議加強(qiáng)配方肥管理，在三部委《關(guān)于加快配方肥推廣應(yīng)用的意見》的基礎(chǔ)上，研究出臺操作性強(qiáng)的配方肥管理辦法，解決大中型企業(yè)“一品一證”和小型企業(yè)“生產(chǎn)許可證”難辦的問題，從政策層面解決企業(yè)參與測土配方施肥工作的積極性。
價格難題
據(jù)省農(nóng)業(yè)節(jié)水與土壤肥料管理總站調(diào)研，配方肥與普通摻混肥相比，沒有價格優(yōu)勢，造成配方肥進(jìn)村、入戶、倒地比較困難。
據(jù)了解，市場普通摻混肥根據(jù)氮肥、磷肥、鉀肥市場價格，靈活調(diào)整氮磷鉀的比例，同一種摻混肥生產(chǎn)批量較大；而配方肥根據(jù)土壤測試結(jié)果、作物需肥規(guī)律、目標(biāo)產(chǎn)量等因素確定氮磷鉀比例，一般鉀、磷比例較高，而鉀、磷肥料單位價格比氮肥高，造成同養(yǎng)分的配方肥生產(chǎn)成本高于普通摻混肥。配方肥針對性強(qiáng)，同一配方的配方肥生產(chǎn)量不大，包裝、庫存成本增加，配方肥沒有價格優(yōu)勢。同時，一線肥料經(jīng)銷商直接面對農(nóng)民，他們對農(nóng)民購肥影響力很大，他們推什么肥，農(nóng)戶一般就買什么肥。但經(jīng)銷商追求利潤最大化，普通復(fù)混肥、摻混肥由于大批量生產(chǎn)零售利潤大，配方肥由于小批量生產(chǎn)利潤相對較小。因此，在現(xiàn)有的管理體制下，一線肥料經(jīng)銷商經(jīng)營配方肥的熱情不高。
技術(shù)難題
測土配方施肥技術(shù)與農(nóng)田節(jié)水、土壤有機(jī)質(zhì)提升等主推技術(shù)集成力度不夠，研發(fā)的配方針對性不強(qiáng)，生產(chǎn)的配方肥適用性不高，限制了配方肥的大面積推廣應(yīng)用。
如“全膜雙壟溝播技術(shù)”，要解決覆膜后追肥難、生產(chǎn)后期脫肥的問題，就需要研究緩控釋配方施肥技術(shù)；在灌區(qū)和日光溫室等保護(hù)性耕作中主推的膜下滴灌、壟作溝灌、壟膜溝灌技術(shù)中，需要研究推廣灌溉、施肥相結(jié)合的水肥一體化施肥技術(shù)；在種植綠肥、秸稈還田、增施有機(jī)肥等土壤有機(jī)提升行動中，要充分考慮到有機(jī)肥在培肥地力、增加土壤養(yǎng)分方面的貢獻(xiàn)，需要研究有機(jī)-無機(jī)相結(jié)合的施肥技術(shù)。但是，由于試驗研究基礎(chǔ)數(shù)據(jù)較少、技術(shù)集成力度不夠，為重大技術(shù)提供支撐的肥料配方較少，制約了配方肥的大面積推廣應(yīng)用。
